Jacobo debutó en la jornada 2 frente al Real Betis Balompié en el que fue su debut en la denominada liga de las estrellas en la primera división del fútbol español, el resultado fue de 0-0 y Jacobo fue denominado mejor jugador del partido y de la jornada por los medios de comunicación españoles aquel 14 de septiembre de 2008. Disputó grandes encuentros en primera división, con 20 partidos jugados y 24 goles encajados entre Liga y Copa, hasta que en el recta final de la liga una expulsión por doble amarilla frente al Valencia Club de Fútbol en el Estadio de Mestalla, en una internada en el área de David Villa actual jugador del Fútbol Club Barcelona y el posterior cambio de entrenador por la sustitución de Víctor Muñoz por Míchel González, exentrenador del Real Madrid CF le volvió a dar la titularidad al ya recuperado portero de Argentina Oscar Ustari.